美国留学签证申请过程中，护照会被收走。具体流程如下：

签证申请时：

在提交签证申请时，护照、I-20表格、DS-160表格、SEVIS I-901表格等相关材料都需要一并提交。其中，护照会在签证审核通过后由签证官收走，用于制作签证页并邮寄回申请人提供的地址。

签证通过后：

如果签证顺利通过，护照会被收走并用于制作签证页，制作完成后会通过邮政EMS邮寄到学生填写的地址附近的中信银行，学生需要去中信银行领取。

签证被拒：

如果签证被拒，所有的上交材料，包括护照，都会被退回给申请人，签证官会提供拒签理由说明，并在护照上盖上“received”的蓝色章。

综上所述，无论是签证申请过程中还是签证通过后，护照都会被收走。建议提前准备好所有必需的材料，并在签证申请时按照要求提交。